项目信息

项目编号：64240526001

项目名称：低剂量照射大鼠甲状腺组织样本的单细胞测序

课题/经费/项目号：

采购方式：公开询价

评审办法：有效最低价

项目类型：技术服务

预算金额：196000.0000

采购人信息

采购单位:与采购方沟通

联系人:guanhua

电话:13521333496

地址:北京市市辖区海淀区海淀区

邮箱:ghlsh@163.com

商品信息

商品信息：低剂量照射大鼠甲状腺组织样本的单细胞测序

数量：1

计量单位：个

商品参数：1、可完成 11 个甲状腺组织样本解离、标记建库、测序及分析；*2、正式实验前 10 个工作日提供一次甲状腺组织样本预实验，并提供解离和细胞活性报告。*3、细胞悬液要求、平台要求、测序需求和数据质控要求：a. 细胞悬液要求：细胞活性≥85%，细胞浓度为 700-1200cells/ul，结团率＜10%，有核率＞70%，细胞数大于 50000；b. 平台要求：利用 CountStar 荧光计数法进行细胞计数；利用 10xGenomics 平台及官方配套试剂完成样本捕获并构建文库；c. 测序需求：要求使用高通量测序平台进行测序；测序质量要求：文库质检合格后，每个转录组文库测序数据量≥100G，测序 Q30＞85%，无 GC 分离；d. 测序数据基因组比对率≥85%，目标捕获细胞数浮动范围在 20%以内，细胞平均 reads>20k，细胞基因中位数≥1000；*4、提供标准生信分析内容：数据质控与过滤、细胞聚类及分群展示、细胞亚型分析、Marker 基因（小提琴图、热图、映射图、dotplot 图）分析、差异表达基因 GO 功能分析（柱状图、气泡图）、差异表达基因 KEGG pathway功能分析（柱状图、气泡图）及可视化结果、细胞类型注释、结果报告完整解读；*5、提供高级生信分析内容：细胞重新分群、拟时序分析、细胞间通讯分析（Cellchat 分析方法和 CellphoneDB 分析方法）、基因集分析、样本间比较及 GO 或 KEGG 分析、基因表达展示（热图、散点图、小提琴图、气泡图）、拷 贝 数 变 异 分 析 （ inferCNV 和 copykat ） 、 单 细 胞 轨 迹 分 析（CytoTRACE）、单细胞 WGCNA 分析、GSVA 分析和 GSEA 分析；*6、对数据进行高级分析；对 10X 单细胞数据分析需根据实验设计、数据结果进行参数优化，根据研究目的设置不同分组比较，辅助进行结果解读数据；挖掘；*7、数据交付内容：所有检测产生的原始数据（raw data）及数据分析过程中产生的数据均需要交付，实验完成周期为收到样本后的 30 个工作日内。

商品备注：

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