长链非编码 rna 测序服务
· 2024-03-12
| 申购单号： | CF105902024000164 | 签约时间： | 发布竞价结果后7天内签约合同 |
| 申购主题： | 长链非编码 RNA 测序服务 | 送货时间： | 合同签订后30天内送达 |
| 采购单位： | 深圳大学 | 安装要求： | 免费上门安装（含材料费） |
| 报价要求： | A | 收货地址： | 广东省/深圳市/南山区/**** |
| 发票类型： | 增值税专用发票 | 币种： | 人民币 |
| 预算： | 128000.0 | 付款方式： | 货到验收合格后付款 |
| 备注说明： | 签订合同后30天内完成。知识产权：双方确定，本项目不论是单方独立完成或双方合作完成的与合作项目有关的阶段性、最终科研成果及相关知识产权权利归甲方所有。 |
| 采购内容 | 数量 | 预算单价 | 品牌 | 型号 | 规格参数 | 质保及售后服务 | |
| 长链非编码 RNA 测序服务 | 1.0None | None | 技术服务 | 技术服务 | 1.完成50例微量RNA样本长链非编码 RNA 信息采集，构建DNBSEQ文库并上机测序，每个样本的目标采集数据量为10G的 clean data，并完成相应的生物信息分析；2、投标人实验室拥有自主DNBSEQ测序平台30台以上。3、基本分析3.1 lncRNA、mRNA、circRNA 信息分析（circRNA 仅限人、小鼠）;1、基本数据统计;① 去除接头序列、低质量序列得到 reads 信息;② 样品相关性;③ 表达量分布;④ RNA 分类;3.2、参考基因组比对;3.3、lncRNA、mRNA、circRNA 鉴定;3.4、lncRNA、mRNA、circRNA 定量分析;3.5、lncRNA、mRNA、circRNA 差异表达分析（样本间、组间）;3.6、lncRNA、mRNA、circRNA 表达/差异基因聚类;3.7、mRNA 差异基因 GO 分类、富集;3.8、mRNA 差异基因 KEGG 分类、富集;3.9、mRNA 结构分析;① 可变剪切分析;② 融合基因分析（仅限人）;3.10、Dr.Tom 多组学数据挖掘系统信息分析; 一）数据库注释;1、转录因子注释（基于基因 ID，在 AnimalTFDB/PlantTFDB 获得注释）2、GSEA分析；3、基于 Uniprot 数据库，获得 Pfam、Reactome、COG、EggNOG 和InterPro数据库注释信息;二）互作网络分析;1、靶基因分析;① miRNA-mRNA 靶向关系分析;② lncRNA-mRNA 靶向关系分析;2、ceRNA 互作网络分析(lncRNA、mRNA);3、蛋白互作网络分析;4、共表达互作网络分析;特色分析;（1）外部数据库关联分析（TCGA、ARCHS4）;（2）关键驱动基因网络图分析;（3）时间序列分析;5、标准数据分析结果需上传到可实现数据循环挖掘的drtom云系统中，该系统需以下功能：（1）展现项目所有标准分析内容；（2）图表互动快速分析；（3）具备个性化处理图片功能等。 | 按行业标准提供服务；知识产权：双方确定，本项目不论是单方独立完成或双方合作完成的与合作项目有关的阶段性、最终科研成果及相关知识产权权利归甲方所有。 |
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