根据《中华人民共和国政府采购法》等有关规定及我所科研需要,现对四川省农业科学院生物技术核技术研究所三份小麦基因组测序、组装注释及个性化数据分析项目进行公开比选,欢迎符合条件的供应商参加比选。
一、项目名称:三份小麦基因组测序、组装及注释
二、项目编号:SAAS-SHS-20250401
三、项目内容及要求
1、项目预算:29.8万元。报价应包含本次项目一切含税费用。
2、项目概况:因科研工作需要,拟开展1份四倍体小麦(基因组大小约11G)和2份节节麦(基因组大小约5G)的基因组测序、组装及注释,现需要供应商根据我们实际需求提供服务,欢迎有资质和有能力的供应商前来参与投标。
3、 技术目标:
(1) 基因组HiFi测序
PacBio Revio三代测序平台;
测序深度≥30×;
HiFi数据平均读长>15 Kb,单个Revio SMRT Cell数据产出大于85 G;
四倍体小麦测4个Cell,节节麦各测2个Cell,合计8个Cell;
下机数据数据Q20>90% & Q30>85%。
(2) 基因组HiC辅助挂载
Illumina NoveSeq测序平台;
测序深度100×;
单个文库数据量>200G;
四倍体小麦测序文库≥5个,每个节节麦测序文库>2个。
(3) 基因组组装
包含contigs组装、染色体构建和组装质量评估;N50不低于60Mbp;组装质量评估参数不少于5项。
(4) 基因组注释
包含重复序列注释、蛋白编码基因注释、蛋白编码基因功能注释(不少于5项)、蛋白编码基因注释质量评估(不低于5项)、非编码基因注释等。
4、 结果交付:下机原始数据、质控数据及组装获得的高质量参考基因组及基因注释文件等。
5、 项目周期及相关要求:测序周期60个工作日;基因组组装和注释60个工作日。
四、比选申请人的资格要求
(1) 投标人应为中华人民共和国境内注册的企业法人或其他组织,具有独立承担民事责任的能力;
(2) 具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;
(3) 具有履行合同所必须的设备和专业技术能力;
(4)
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